Православная церковь на протяжении веков была самостоятельной, но в Петровские времена случился поворот – она стала частью государства. Именно частью, а не слилась с ним. Влияние религиозных организаций на общество на протяжении веков было огромным. Например, на Востоке религиозную
и государственную власть совмещали первые халифы (халиф – глава мусульманского государства). Султанат Бруней и Саудовская Аравия и по сей день – государства теократические (форма государства, где политическая и религиозная власть сосредоточена
в руках одного человека). В Европе же ситуация отличалась, но Папа Римский был сильнейшим авторитетом.
Генрих Восьмой Тюдор, король английский, благополучно порвал отношения с Ватиканом. Противники англиканской церковной реформы и просто оппоненты монарха (например Томас Мор, философ и писатель-гуманист) были казнены, как изменники страны.
Тем временем, в России 16 января 1547 года Иван IV венчается на царство митрополитом Макарием, как первый русский царь. Известно, что по поводу этого решения он советуется именно с религиозными деятелями: для бояр появление царя стало большой неожиданностью.
Русское Патриаршество было учреждено в Москве
в 1589 году. Первым патриархом стал Иов, сподвижник Годунова. Иов был лично знаком с Лжедмитрием I, поэтому был смещен с поста и стал обычным монахом
в заключении. Патриарх Московский и всея Руси
в 1619—1633 годах – Филарет (Фёдор Никитич Романов), основатель династии Романовых, племянник Анастасии Романовны жены Ивана Грозного, в религию попал насильно, по повелению Бориса Годунова. Хитрые политические действия в период Смутного Времени позволили ему «протолкнуть» кандидатуру своего сына Михаила на русский престол (1613 год).
Михаил Федорович скончался в 1645 году, в возрасте 49-ти лет. Именно с него в стране начались светские реформы. Молодой царь Алексей Михайлович уважал патриарха Никона, доверял его советам в делах государственного управления, а во время войн с Речью Посполитой оставлял «за главного». Никон одно время даже имел титул «Великий Государь». Впрочем, пользовался своей властью и самостоятельностью
в полной мере, Алексей даже заявил, что не будет вмешиваться в церковные дела. Соборное уложение 1649 года хоть и содержало суровые наказания
за богохульство и «изменение» веры, всё же перенаправляло доходы от монастырских вотчин в казну через особый Монастырский приказ. Суды мирские могли рассматривать дела церковные.
Постепенно нарастал конфликт между Алексеем Михайловичем и Никоном. В 1650-х Никон лично осуществлял реформу церкви для унификации
с греческими «коллегами». Это привело к церковному расколу и старообрядчеству. Против патриарха восстали и бояре, и часть духовенства. В 1658-м в качестве протеста оставил Москву: он удалился в находящейся
в личной собственности и основанный им Воскресенский Новоиерусалимский монастырь в городе Истра. Царь был обижен. Для расследования деятельности патриарха были приглашены иностранные клерики, начались долгие разбирательства. В 1666 году архиереи после долгих прений приняли решение «извергнуть Никона
из патриаршества». Новый царь Фёдор III Алексеевич (старший брат царей Ивана V и Петра I ) реабилитировал Никона и продолжил гонения
на старообрядцев: при нем был сожжен главный идеолог непринятия реформ – протопоп Аввакум.
Царь скоропостижно скончался в возрасте 20-ти лет.
Из-за борьбы Милославских и Нарышкиных, патриарх Иоаким предложил провозгласить царями сразу обоих единокровных братьев при регентстве Софьи Алексеевны, что было сделано в 1682-м году.
Вот отрывок из письма семнадцатилетнего Петра брату Ивану по случаю смещения Софьи и ее ставленников (1689 год):
«А теперь, государь братец, настоит время нашим обоим особам Богом врученное нам царствие править самим».
Иван был болезненным человеком и рано скончался.
Концентрация абсолютной власти в руках Петра требовала устранения иной силы, способной влиять
на массы. В 1700 году скончался патриарх Адриан и Петр назначил малороссийского митрополита Стефана Яворского блюстителем патриаршего престола
(= исполняющим обязанности). В 1718 был разработан Духовный Регламент, а в 1721 издан Манифест
об учреждении Духовной коллегии. В жизни церкви начался синодальный период (длился он до 1917).
После получения разрешения от константинопольских чинов, Духовная коллегия стала Синодом.
Святейший Синод был высшей административной
и судебной инстанцией Русской церкви. Ему принадлежало право, с одобрения верховной власти Российской империи, открывать новые кафедры, избирать и поставлять епископов, устанавливать церковные праздники и обряды, канонизировать святых, осуществлять цензуру в отношении произведений богословского, церковно-исторического и канонического содержания. Гражданскую власть представлял обер-прокурор Синода – его роль с 18 века постепенно усиливалась.